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玻片的準備和樣品固定

電熱鼓風干燥箱對于染色體涂片，1：1的乙醇/醚處理的載玻片已能符合要求。對于組織切片的原位雜交，為了在實驗過程中不丟失組織樣品，可使用多聚賴氨酸或鉻礬明膠包被的載玻片。

樣品的固定步驟是為了保持樣品的原有形態學。樣品固定是原位雜交中必不可少的步驟，從化學反應角度來看，固定劑的使用和選擇對后續雜交的影響不會太大，因為核酸雜交的功能分子基團被安全地包裹在DNA雙螺旋結構中，而交聯劑的使用對RNA基本沒有影響。對于染色體涂片，常使用甲醇/醋酸溶液固定；石蠟包埋的組織切片用福爾馬林固定。冷凍切片可通過在4%的甲醛溶液中固定30min，或使用Bouin固定劑。